Обязанность составлять счета-фактуры, вести журналы учета полученных и выставленных счетов-фактур, книги покупок и книги продаж возложена на плательщиков НДС. Налогоплательщиками признаются организации. Структурные подразделения организаций налогоплательщиками налога на добавленную стоимость не являются.
Поэтому в случае, если товары реализуются через подразделения, не являющиеся юридическими лицами, то счета-фактуры по отгруженным товарам могут выписываться покупателям этими подразделениями только от имени организации, - поясняет Минфин в своем письме .