Что касается представления сведений о доходах физических лиц, эта обязанность напрямую связана с обязанностью уплачивать НДФЛ по месту учета налогового агента в налоговом органе. То есть сведения о доходах работников обособленных подразделений подаются в налоговый орган по месту нахождения обособленного подразделения (в тот налоговый орган, в который производится перечисление налога).
Если сотрудник в течение месяца работает и в обособленном подразделении, и в головной организации, НДФЛ с его доходов перечисляется в соответствующие бюджеты: и по месту нахождения обособленного подразделения, и по месту нахождения головной организации — с учетом отработанного времени.
Следовательно, сведения о его доходах представляются как в налоговый орган по месту нахождения обособленного подразделения, так и в налоговый орган по месту нахождения головной организации.